La tolerancia no significa que te agrade la presencia de otro.Ni que estés obligado a mostrar un agrado inexistente. Es más, el término lleva implícito que no te hace mucha gracia la presencia del otro, pero que aún así la admites.
Porque tolerar literalmente significa " soportar", y soportas, aguantas , algo que en principio no es de tu agrado.
Se dice tolerancia al dolor en el sentido de soportar equis dolor, intolerancia a la lactosa en el sentido de que no puedes soportar su consumo...etc....tolerar implica necesariamente una carga , un esfuerzo para soportar algo que en principio no se supone agradable.
Saludos